מונע מעבר חופשי של חומרים מזרם הדם אל תוך רקמת המוח. אופן הפעולה של מחסום דם-מוח: בשונה משאר הגוף במבנה הנימים במוח אין רווחים בין התאים ולכן על מנת להגיע לרקמת המוח יש צורך לעבור מבעד לממברנת תאי הנים.חומרים הידרופובים (מסיסים בשומן) יכולים לעבור באופן חופשי מבעד למחסום. חומרים הידרופילים (מסיסים במים) על מנת שיוכלו לעבור יש צורך בתעלה או נשא בקרום תאי -הנים.
